攀枝花市疾病预防控制中心病原体基因组测序服务采购项目比选公告

因工作需****花市疾病****中心拟采****基因组测****特邀请符****购要求的****该项目的****一、项目**** 《攀枝****预防控制****体基因组****》采购项****、项目内****本项目采****高限价***** *.采**** 序号 **** 菌株/**** 计量单****单价限价**** 备注 ****全基因组****实际检测**** 株 ***** 宏基因****以实际检****为准 份***** 预算**** *******★三、项****求 （一****基因组测****求： *****长：平均****为*********，最****过********.数据*******（****%）>******.碱基****均匀，无****；平均覆*****.*%****供测序过****时监控报****.原始数****基数）≥****；*******据大小不*****； *****覆盖度≥****基因区覆*****%，整****度≥******保覆盖度****避免某些****度不足；******>********>****； *.****和结构变****：要求能****报告重复****构变异；****据质量控****要求提供*****报告，****前后的样****估； *****付和格式************应要求提****或*******对文件，****检测的*****。 ******保上传国****识别网。****细菌全基****报告内容****原始数据****量评估:**** 下机数****制: 应****平台提供****量评分和****布图； ****数据过滤****确过滤标******或*****，以及去************序列； ****测序错误****%，且基****度的******数）不超****，确保数****性和一致****.序列拼**** *.*****序列及其****应提供详****结果，包****/*******组大小、****等，并与****组进行比****.基因预****要优化为****释，包括*************等非编****的预测，****前认可的****软件进行****用如**************** ****** *************************)****流程。 ****菌毒力因******）分****使用最新*****数据库****毒力因子****释和相关****。提供毒****抗性基因****析，包括****、序列和****。 *.****性（******析: 应****版*******，并提供****的详细信****基因、相****和可能的****。 *.****分析: ****参考基因****变体分析****对*******变体原始****件。 *****据: 云****，或通过****据下载平****据交付。****宏基因组****要求： ****读长：平****长为*********，****超过******同时结合****术（如******或********），****少*,*****的平均读****.数据准******（*****）>******.原始数****基数）≥*****；根据****期微生物****研究目标****据量的计****公式，确****足以覆盖****生物种类**** *.覆****的统计数****样本中不****的覆盖度*****.提供****成分析，****丰富度和****数； *****于测序数****通路和功****预测； ****完整的数****制报告，****前后的样****估； *****保上传国****识别网。****宏基因组****内容： ****数据统计***** 测序****值: 应*****或更高****例，******%； *****序碱基含**** 应确保****的分布均****显偏差；**** 测序质**** 应包括****的详细质****表和指标***** 测序****统计: ****序深度、****数据量的****。 *.****: 需要****的指标，****、*******组装的完****确性。 ****预测以及****建: ******** ************信息统计****括基因预****、长度分*****.* ****丰度的样****性和韦恩****应提供样****丰度的相****和多样性*****.物种****度分析:****类分析、****热图、降****关联网络****确保使用****流程和最****信息学工****库。 *****异分析:*******、*****、********、*****分析:确****间差异分****计学意义****详细的结**** *.功****析: 功****数据库注****功能丰度****维分析:****标准化的****流程进行****。 *.****丰度的组****析: ******、********、*****分析:确****方法的适****果的解释****抗性基因****抗性基因****概况、组****析: 应****的抗性基****，如*********。****基因组*******: ****每个******性应达到****上；污染******%；**** 每个*****因组覆盖******×以*******内****量应与其****生物种类****量一致；**** 至少包****的已知单****基因，如****基因、保****途径基因****.* 通**** *******其他保守****对，确保****的序列与****组的一致****.* 能****少**%****平的微生****员； *****用当前认************算法，如*******、******等；****检查和验************务； *****供*******结果的可****，如基因****图、物种****。 （五****密要求（****求，在响****具相应承****成交供应****国家法律****度重视安****作，成交****与采购人****协议，保****应包含且****述内容：****购人及采****中的数据****得将采购****其相关数****第三方及****等。 四****关事宜 ****目采用最****法进行评****期限为三****一年一签****期后经我****年服务结****格后则续****考核不合****合同。 ****报价为包****购人不再****根据成交****实际检测****的结算金****其他任何**** ★*.****须提供的****： （*****业执照副****； （*****表人身份****复印件；****法定代表****原件及被****身份证复****法定代表****供）； ****务商实验****级及以上****实验室备*****.报价****供的承诺**** （*）****承担民事****力； （****良好的商****健全的财****度； （****履行合同****设备和专****力； （****年内在经****没有重大****； （*****动前三年****贿犯罪记*****）具备****政法规规****条件； ****范投标承*****.标注****要求内容****选项目的****求，如不****其投标文****无效处理****根据项目****相关资料****（需装订****并加盖报****章）。 ****投标文件****时间*******月******:**分****件可快递****（需用顺****或递交到****疾病预防****办公楼***** *.联****地址：攀****区三线大******号 ****陈老师，****：***************花市疾病****中心 *******月**